История и современность
Летопись столетий
| 1605г. | – Основание Усть-Киргизского (Богородского) мужского монастыря в 9 верстах от Томска на р. Большая Киргизка. |
| 1606г. | – половодьем сносятся церковь и монастырские постройки. Монастырь переносится на более высокое и безопасное место вверх по течению реки. |
| 1620г. | – с назначением в Тобольск первого сибирского архиепископа Киприана монастырь входит в состав Сибирской и Тобольской архиепископии (до этого находился в составе Вологодской епархии) |
| 1656г. | – случился пожар, уничтоживший новый деревянный храм обители. Монастырь переносится в Томск на Юрточную гору |
| 1656г. | – Царь Алексей Михайлович пожаловал монастырю первый надел земельных владений за пределами Томска |
| 1662г. | – в монастыре был возведен первый деревянный трехпрестольный храм в честь Казанской иконы Божией Матери с приделами в честь преподобного Алексия Человека Божия и мучеников Флора и Лавра. |
| 1663 г. | – завершение строительства монастыря на новом месте. |
| 1681г. | – монастырь в числе трех старейших сибирских обителей принят под личное покровительство царя Феодора Алексеевича |
| 1695г. | – игумены Богородице-Алексиевского монастыря получают сан архимандритов. |
| 1698г. | – в монастыре была открыта первая в Томске школа. |
| С 17 века при монастыре организована первая в городе больница и богадельня. | |
| 1746г. | – в монастыре открывается русское духовное училище. |
| 1750-е гг. | –архим. Исайя установил «начальствующий монастырский благовест»: городские церкви должны были начинать и заканчивать колокольные звоны по звону монастырской церкви. |
| 1764г. | – монастырь становится штатным и причисляется к 3-му классу. Его настоятели вновь становятся игуменами. |
| 1769г. | – к томской обители был присоединен Кузнецкий Христорождественский монастырь. |
| 1776г. | – закладывается первый каменный храм обители |
| 1779г. | – освящаются боковые приделы нового храма в честь преподобного Алексия Человека Божия и мучеников Флора и Лавра |
| 1789г. | – освящается главный придел храма в честь Казанской иконы Божией Матери |
| 1807г. | – восстановление архимандритии в монастыре |
| 1818г. | – при монастыре устроена русско-латинская гимназия |
| 1820г. | – гимназия преобразована в Томское духовное училище |
| 1834г. | – открытие Томской епархии |
| 1835г. | – Богородице-Алексиевский монастырь становится резиденцией томских архиереев, на территории монастыря был построен архиерейский дом |
| 1836г. | – начата постройка каменной монастырской ограды |
| 1860г. | – строится колокольня каменного собора |
| 1863г. | – в обители установлен «Торжественный» 303-пудовый колокол |
| 1864г. | – кончина старца Феодора Кузьмича (св. прав. Феодора Томского) |
| 1884г. | – в монастыре был построен каменный настоятельский корпус |
| 1891 г. | – обитель посещает Цесаревич Николай Александрович, будущий царь Николай II. |
| 1904г. | – над склепом св. Феодора Томского возводится каменная часовня |
| 1908г. | – настоятелями Богородице-Алексиевского монастыря становятся викарные епископы с титулом «Барнаульский» |
| 1923г. | – закрытие монастыря; последним настоятелем обители был архимандрит Ираклий (Попов), который, впоследствии став епископом на Урале, расстрелян в 30-х годах |
| 1923г. | – многочисленные явления св. прав. Старца Феодора Томского у часовни и над стенами обители |
| 1936г. | – сгорело, было перестроено и отчуждено от монастыря здание архиерейского дома и домовой церкви |
| 1936г. | – была разобрана часовня св. прав. Феодора Томского |
| 1937г. | – была подожжена загородная церковь Покрова Пресвятой Богородицы |
| 1941-45г. | – в монастыре располагается военный госпиталь |
| 1960-е гг. | разбирается каменная ограда и ворота обители |
| 1991г. | – территорию обители посетил Святейший Патриарх Алексий II. |
| 1992г. | – епископ Новосибирский и Бердский Тихон совершил торжественное открытие Томского Богородице-Алексиевского монастыря |
| 1995г. | – обители был передан отреставрированный Казанский собор |
| 1995г. | – состоялось обретение мощей св. прав. Феодора |
| 1996г. | – возвращен бывший настоятельский корпус, где теперь размещаются монашеские кельи |
| 1996-1998г. | – восстановлена часовня св. прав. Феодора Томского |
| 1999г. | – наместником монастыря был назначен ныне действующий игумен Силуан (Вьюров) |